Protein–RNA interactions for Protein: Q149C2

Traf3ip1, TRAF3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Traf3ip1Q149C2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Traf3ip1Q149C2 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Spr-ps1-201ENSMUST00000089584 605 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Traf3ip1Q149C2 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
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