Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Tom1l2-201ENSMUST00000064019 2151 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
VgfQ0VGU4 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
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VgfQ0VGU4 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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VgfQ0VGU4 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Por-202ENSMUST00000122113 2606 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Snrpf-201ENSMUST00000020203 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
VgfQ0VGU4 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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