Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Nudt18-203ENSMUST00000228768 1578 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 AC157650.3-201ENSMUST00000225058 1476 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Kctd10-201ENSMUST00000001125 1026 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm16198-201ENSMUST00000118766 670 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm17399-201ENSMUST00000181824 1181 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm7774-201ENSMUST00000200064 533 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm31816-201ENSMUST00000209388 1294 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Olfr975-201ENSMUST00000054067 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Dusp13-201ENSMUST00000075040 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Zfp715-201ENSMUST00000012796 907 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm10253-201ENSMUST00000194270 940 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 AI463170-203ENSMUST00000219353 430 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cd151-201ENSMUST00000058746 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Kir3dl1-201ENSMUST00000113104 1031 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Rerg-203ENSMUST00000119610 890 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cox6b2-203ENSMUST00000182111 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cyhr1-201ENSMUST00000066677 1163 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 AC126250.1-201ENSMUST00000228343 1768 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Lcn5-202ENSMUST00000100312 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Ncr3-ps-201ENSMUST00000134687 525 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Hddc3-206ENSMUST00000206074 565 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cd3g-201ENSMUST00000002101 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm11937-201ENSMUST00000076478 396 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Wscd1-202ENSMUST00000108510 2956 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 2010015M23Rik-201ENSMUST00000181900 1199 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Plpp4-203ENSMUST00000205896 714 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Gm31105-201ENSMUST00000211421 687 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Gli2Q0VGT2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Psmc5-201ENSMUST00000021049 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Aifm2-202ENSMUST00000080099 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ppp1r1a-201ENSMUST00000023133 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Dhdds-202ENSMUST00000105885 998 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Prss47-201ENSMUST00000182457 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Tmem86b-204ENSMUST00000206610 522 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Gli2Q0VGT2 Myog-201ENSMUST00000027730 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms