Protein–RNA interactions for Protein: Q0VF55

Atp2b3, Calcium-transporting ATPase, mousemouse

Predictions only

Length 1,220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2b3Q0VF55 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Tdg-ps-201ENSMUST00000051363 2968 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 A330070K13Rik-201ENSMUST00000063656 633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Taf5-201ENSMUST00000026027 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Atp2b3Q0VF55 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms