Protein–RNA interactions for Protein: Q0VDN7

Rundc1, RUN domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 615 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rundc1Q0VDN7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Lrrc25-201ENSMUST00000052437 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cant1-204ENSMUST00000106288 2873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm7862-201ENSMUST00000121461 292 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rundc1Q0VDN7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Cndp2-201ENSMUST00000025546 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm45844-204ENSMUST00000209833 1524 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm13418-201ENSMUST00000119097 944 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Aurkaip1-201ENSMUST00000084097 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rundc1Q0VDN7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.4 ms