Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBD0

Itgb8, Integrin beta, mousemouse

Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb8Q0VBD0 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Foxl1-201ENSMUST00000181609 2705 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Sirpa-202ENSMUST00000099113 3342 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ss18-203ENSMUST00000092041 2997 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Itgb8Q0VBD0 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms