Protein–RNA interactions for Protein: Q0P5W1

Vps8, Vacuolar protein sorting-associated protein 8 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,427 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps8Q0P5W1 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm26613-201ENSMUST00000180919 1457 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Vps8Q0P5W1 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm36584-201ENSMUST00000209046 708 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Lhpp-201ENSMUST00000033241 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Prdm5-203ENSMUST00000081219 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Idh2-201ENSMUST00000107384 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Haghl-211ENSMUST00000150324 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 1700016B15Rik-201ENSMUST00000209027 733 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Tsfm-201ENSMUST00000040560 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Spock3-204ENSMUST00000119068 3201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Lypd1-205ENSMUST00000162899 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 AC127302.2-201ENSMUST00000215212 268 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Slc35c2-203ENSMUST00000109299 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Mfge8-201ENSMUST00000032825 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Map2k3-201ENSMUST00000019076 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Olfr541-201ENSMUST00000080681 1103 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps8Q0P5W1 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms