Protein–RNA interactions for Protein: Q0HA38

Ttc21b, Tetratricopeptide repeat protein 21B, mousemouse

Predictions only

Length 1,315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc21bQ0HA38 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Erich4-201ENSMUST00000098663 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mycbp-201ENSMUST00000030400 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm2109-201ENSMUST00000189326 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 4933434E20Rik-204ENSMUST00000159064 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Tmub1-201ENSMUST00000030799 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Erp27-201ENSMUST00000032343 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ccdc182-201ENSMUST00000037268 1204 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 AC131104.1-201ENSMUST00000222118 1739 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm21984-201ENSMUST00000123117 822 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Rgs10-201ENSMUST00000033133 880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Ttc21bQ0HA38 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Larp1b-205ENSMUST00000191805 1581 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm13332-201ENSMUST00000120451 1398 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Rapgef6-205ENSMUST00000108895 1829 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Arid2-202ENSMUST00000134985 809 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Ttc21bQ0HA38 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.5 ms