Protein–RNA interactions for Protein: Q08AU9

UPF0450 protein C17orf58 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q08AU9 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Q08AU9 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q08AU9 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q08AU9 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q08AU9 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q08AU9 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Q08AU9 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ntrk2-205ENSMUST00000224402 2284 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm4756-201ENSMUST00000207585 1716 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Q08AU9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Q08AU9 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Pth1r-204ENSMUST00000198865 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
Q08AU9 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q08AU9 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q08AU9 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
Q08AU9 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms