Protein–RNA interactions for Protein: Q08423

Tff1, Trefoil factor 1, mousemouse

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Length 87 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff1Q08423 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
Tff1Q08423 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gba2-201ENSMUST00000030189 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gps1-207ENSMUST00000172809 2000 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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Tff1Q08423 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Plcb1-205ENSMUST00000131552 7202 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Ythdc2-201ENSMUST00000037763 7215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Tbc1d10b-201ENSMUST00000120705 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tff1Q08423 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tff1Q08423 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tff1Q08423 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
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Tff1Q08423 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Shox2-202ENSMUST00000162060 1537 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Tff1Q08423 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
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