Protein–RNA interactions for Protein: Q08189

Tgm3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tgm3Q08189 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Cfap20-208ENSMUST00000213086 2544 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 9430038I01Rik-202ENSMUST00000117404 699 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Tgm3Q08189 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 4930512B01Rik-201ENSMUST00000021378 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Tgm3Q08189 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms