Protein–RNA interactions for Protein: Q07916

Pou6f1, POU domain, class 6, transcription factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 301 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pou6f1Q07916 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pqlc1-208ENSMUST00000144468 1050 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Plpp7-201ENSMUST00000057423 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Col17a1-202ENSMUST00000086923 5477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pnkp-202ENSMUST00000098478 1550 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Pou6f1Q07916 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 2810468N07Rik-201ENSMUST00000163493 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Pou6f1Q07916 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms