Protein–RNA interactions for Protein: Q07409

Cntn3, Contactin-3, mousemouse

Predictions only

Length 1,028 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntn3Q07409 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm2694-204ENSMUST00000181898 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dnajb8-201ENSMUST00000061866 990 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Stradb-201ENSMUST00000027185 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cntn3Q07409 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms