Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rspry1-207ENSMUST00000212729 2800 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Kif3a-201ENSMUST00000057330 2290 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cfap206-201ENSMUST00000029971 2246 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm4262-201ENSMUST00000180624 1986 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Mrps35-201ENSMUST00000036111 4162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm10605-202ENSMUST00000183019 3198 ntBASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Vldlr-208ENSMUST00000172302 3855 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cd5l-201ENSMUST00000015998 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Lmbr1-204ENSMUST00000198105 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Nop53-201ENSMUST00000044158 3176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Pard6b-201ENSMUST00000052125 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Sapcd2-201ENSMUST00000028329 3121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Skap1-205ENSMUST00000107662 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Nkx6-1-201ENSMUST00000044125 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ankrd13b-202ENSMUST00000092892 3336 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Iscu-202ENSMUST00000112311 1395 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Smg9-201ENSMUST00000002280 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Caln1-203ENSMUST00000111288 9327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Sybu-203ENSMUST00000110269 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Barhl2-201ENSMUST00000086795 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Depdc1b-201ENSMUST00000051594 2563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Psmd13-201ENSMUST00000026560 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gdf3Q07104 Elavl3-203ENSMUST00000215901 3037 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms