Protein–RNA interactions for Protein: Q06985

Siah1b, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH1B, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah1bQ06985 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Chchd7-203ENSMUST00000119307 889 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm3764-206ENSMUST00000181356 1088 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Iqcd-201ENSMUST00000069259 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Hmgn1-201ENSMUST00000050884 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm11779-201ENSMUST00000118541 368 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Sdhc-201ENSMUST00000081560 815 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Prkag1-201ENSMUST00000168846 1638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm13830-202ENSMUST00000144202 381 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm45188-201ENSMUST00000207592 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rbm42-202ENSMUST00000108141 1526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rhobtb3-201ENSMUST00000022078 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm6257-201ENSMUST00000163864 910 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Siah1bQ06985 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.3 ms