Protein–RNA interactions for Protein: Q06831

Sox4, Transcription factor SOX-4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox4Q06831 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sec61g-206ENSMUST00000166950 754 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sec61g-207ENSMUST00000178855 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Slc25a2-201ENSMUST00000058635 1369 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Sox4Q06831 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Cygb-201ENSMUST00000021166 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Crybb1-202ENSMUST00000112375 793 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm44264-201ENSMUST00000203049 742 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Sox4Q06831 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms