Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Coro6-201ENSMUST00000021190 1418 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Elp6-205ENSMUST00000199592 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Npb-201ENSMUST00000061309 418 ntTSL 3 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gde1-201ENSMUST00000038791 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 H2-K1-202ENSMUST00000087189 579 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Klhl42-201ENSMUST00000036003 6267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Dnajc3-201ENSMUST00000022734 5141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Tspan31-201ENSMUST00000060991 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Psmb5-ps-201ENSMUST00000119744 798 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rhox2a-202ENSMUST00000173650 735 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rhox2c-204ENSMUST00000184688 720 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm9172-201ENSMUST00000212092 954 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Ndufv3-202ENSMUST00000064798 485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Styxl1-204ENSMUST00000111163 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 H2-Bl-209ENSMUST00000194244 862 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Gm7229-201ENSMUST00000214719 1007 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Prrx2Q06348 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.22
Prrx2Q06348 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms