Protein–RNA interactions for Protein: Q05A62

Dnal1, Dynein light chain 1, axonemal, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnal1Q05A62 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Mau2-204ENSMUST00000212308 2887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Phospho2-202ENSMUST00000112266 2194 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Kcnc1-201ENSMUST00000025202 7760 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Slc22a7-201ENSMUST00000087012 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Dnal1Q05A62 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tox3-201ENSMUST00000109621 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Pcolce2-201ENSMUST00000015498 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fam167a-201ENSMUST00000121288 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Scaf4-201ENSMUST00000039280 4165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Dnal1Q05A62 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms