Protein–RNA interactions for Protein: Q05860

Fmn1, Formin-1, mousemouse

Predictions only

Length 1,466 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fmn1Q05860 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 3110079O15Rik-201ENSMUST00000027476 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm8281-202ENSMUST00000163719 1954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cby3-202ENSMUST00000164067 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Lmna-202ENSMUST00000036252 1536 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Rpl26-206ENSMUST00000167436 606 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Psmb10-201ENSMUST00000034369 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Fmn1Q05860 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Calcb-201ENSMUST00000032902 962 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 C1qa-201ENSMUST00000046285 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Iqcj-201ENSMUST00000063263 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Foxs1-201ENSMUST00000099200 1311 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Cldn25-ps-201ENSMUST00000197641 693 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Mir6956-201ENSMUST00000183598 62 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gdf5-201ENSMUST00000040162 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm44335-201ENSMUST00000196879 141 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm44297-201ENSMUST00000198304 141 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm44346-201ENSMUST00000198851 141 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Mlnr-ps-201ENSMUST00000208959 969 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm3252-201ENSMUST00000165619 1949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ifna12-201ENSMUST00000102806 797 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm6226-201ENSMUST00000117765 1146 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 9130204K15Rik-201ENSMUST00000131441 867 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Hnrnpa1l2-ps2-201ENSMUST00000022493 963 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Fmn1Q05860 Gm20553-201ENSMUST00000204205 844 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms