Protein–RNA interactions for Protein: Q04887

Sox9, Transcription factor SOX-9, mousemouse

Predictions only

Length 507 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox9Q04887 Hist1h2br-202ENSMUST00000110476 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Vdac2-209ENSMUST00000173456 956 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rian-216ENSMUST00000183215 880 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Abhd18-207ENSMUST00000203892 1021 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm45612-201ENSMUST00000211320 160 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rnaseh2a-201ENSMUST00000065049 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Hist1h2bq-201ENSMUST00000078156 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Hist1h2al-201ENSMUST00000091708 339 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Anks1b-219ENSMUST00000182600 1697 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mettl16-201ENSMUST00000010698 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm32369-201ENSMUST00000222630 1467 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Nrn1-204ENSMUST00000224323 1779 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 4933412A08Rik-201ENSMUST00000061046 1343 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pou2f3-rs1-201ENSMUST00000120271 1046 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Umad1-206ENSMUST00000160705 624 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Slc25a5-201ENSMUST00000016463 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 BC022687-202ENSMUST00000177808 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm37335-201ENSMUST00000192656 447 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cyp2d40-201ENSMUST00000055721 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Renbp-201ENSMUST00000114379 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Sox9Q04887 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Sox9Q04887 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms