Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Degs1-201ENSMUST00000035295 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Sox8Q04886 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ilvbl-204ENSMUST00000218271 1606 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Lce3f-201ENSMUST00000090863 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Smox-204ENSMUST00000110181 2299 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Flot1-209ENSMUST00000174080 1383 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Gm8097-201ENSMUST00000117903 829 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Sox8Q04886 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms