Protein–RNA interactions for Protein: Q04750

Top1, DNA topoisomerase 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 767 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top1Q04750 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fbxo30-202ENSMUST00000129456 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Dnm2-211ENSMUST00000173397 3510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Anks1-201ENSMUST00000025058 6844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Slc5a5-201ENSMUST00000000809 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Phf21b-203ENSMUST00000159939 3639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ddc-202ENSMUST00000109659 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Smox-203ENSMUST00000110180 1617 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tcf3-210ENSMUST00000105346 2839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Vcan-201ENSMUST00000109543 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ppp6r2-208ENSMUST00000228284 3297 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Ip6k2-206ENSMUST00000193560 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Uqcr11-201ENSMUST00000020372 445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Top1Q04750 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms