Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rasgef1b-206ENSMUST00000161516 2523 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tpm4-201ENSMUST00000003575 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rundc3b-201ENSMUST00000047485 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Fgf11-202ENSMUST00000102585 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC15.39■□□□□ 0.06
Emx2Q04744 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Gm38327-201ENSMUST00000195852 1755 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Emx2Q04744 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.1 ms