Protein–RNA interactions for Protein: Q04692

Smarcad1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A containing DEAD/H box 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,021 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarcad1Q04692 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Coq6-201ENSMUST00000021661 1602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tacc1-202ENSMUST00000084512 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Il11ra1-204ENSMUST00000108042 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Slc1a6-201ENSMUST00000005490 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Hnrnpa1-202ENSMUST00000087351 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Malt1-201ENSMUST00000049248 5073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Krt6b-201ENSMUST00000023786 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Znhit2-201ENSMUST00000162726 1281 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Has3-202ENSMUST00000175987 1154 ntTSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Miga1-205ENSMUST00000199397 2842 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Smarcad1Q04692 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms