Protein–RNA interactions for Protein: Q04207

Rela, Transcription factor p65, mousemouse

Predictions only

Length 549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelaQ04207 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RelaQ04207 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 A830009L08Rik-201ENSMUST00000181054 2807 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Espnl-202ENSMUST00000176156 2886 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gata4-202ENSMUST00000118022 3374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm42901-201ENSMUST00000197735 3171 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gusb-203ENSMUST00000111308 2038 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Fbxo34-201ENSMUST00000043112 2937 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Cenps-207ENSMUST00000177408 689 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Spdya-202ENSMUST00000124001 1247 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Naa50-203ENSMUST00000159514 3756 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 1700001O22Rik-201ENSMUST00000050003 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Gm7370-201ENSMUST00000219471 767 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
RelaQ04207 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.3 ms