Protein–RNA interactions for Protein: Q03958

Pfdn6, Prefoldin subunit 6, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn6Q03958 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Slc4a5-202ENSMUST00000113899 5039 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Acot4-201ENSMUST00000021652 6203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Zswim4-201ENSMUST00000039480 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Lmo4-202ENSMUST00000121112 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Tpcn1-201ENSMUST00000046426 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Itgav-202ENSMUST00000111740 6788 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Knop1-205ENSMUST00000116280 5382 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Dab2ip-202ENSMUST00000091010 6455 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC16.14■□□□□ 0.18
Pfdn6Q03958 Socs7-201ENSMUST00000045540 7015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Sh2b1-202ENSMUST00000205340 3366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Ptprm-202ENSMUST00000223982 4802 ntAPPRIS P2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Pfdn6Q03958 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms