Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cyp21a1-201ENSMUST00000025223 2058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fam110a-201ENSMUST00000062047 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Exoc8-201ENSMUST00000098312 4598 ntAPPRIS P1 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ate1-203ENSMUST00000094017 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Kcnb1Q03717 Haus3-201ENSMUST00000060049 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms