Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm3336-201ENSMUST00000179347 1149 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm3336-202ENSMUST00000213065 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ube2w-201ENSMUST00000117146 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ppp1r11-201ENSMUST00000040402 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Cyp11b2-201ENSMUST00000167634 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm37711-201ENSMUST00000194907 1749 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Itm2c-201ENSMUST00000027425 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Acyp2-201ENSMUST00000074613 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Scg2Q03517 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms