Protein–RNA interactions for Protein: Q03404

Tff2, Trefoil factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tff2Q03404 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Tff2Q03404 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Asphd1-202ENSMUST00000106339 518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 4930593A02Rik-202ENSMUST00000203879 938 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Pfkfb4-201ENSMUST00000051873 3316 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Usf2-202ENSMUST00000108119 849 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Chchd6-202ENSMUST00000113550 1042 ntTSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm37153-201ENSMUST00000193637 231 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Chchd6-201ENSMUST00000032172 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Orc6-201ENSMUST00000034132 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Sept8-207ENSMUST00000147912 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Crhbp-202ENSMUST00000221025 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Meig1-204ENSMUST00000115083 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 4930481B07Rik-201ENSMUST00000128160 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Znrf1-213ENSMUST00000174333 515 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Lin37-201ENSMUST00000043975 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nrip2-202ENSMUST00000120405 1468 ntTSL 2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Hr-203ENSMUST00000161069 5607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Atp6v1c2-201ENSMUST00000020884 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Tmem253-201ENSMUST00000100638 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 AC158804.1-201ENSMUST00000219046 541 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Tff2Q03404 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms