Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Rnd1-201ENSMUST00000003451 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.3
Ddr1Q03146 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm6277-201ENSMUST00000180860 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ush1c-208ENSMUST00000177212 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Camk2d-204ENSMUST00000106400 2722 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Inhba-202ENSMUST00000164993 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Pnkp-203ENSMUST00000107876 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Entpd6-201ENSMUST00000094467 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Sgk1-202ENSMUST00000092673 2576 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Mvd-201ENSMUST00000006692 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Fam221a-201ENSMUST00000060561 2730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Ddr1Q03146 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.5 ms