Protein–RNA interactions for Protein: Q02853

Mmp11, Stromelysin-3, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mmp11Q02853 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 AC069562.2-201ENSMUST00000224644 2146 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Golph3-201ENSMUST00000059680 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Ndufb11-201ENSMUST00000116621 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Cd2bp2-201ENSMUST00000035771 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mmp11Q02853 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cnih3-201ENSMUST00000027795 2668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Prss54-201ENSMUST00000052690 1438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mid1-206ENSMUST00000112107 3194 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Mir124-2hg-202ENSMUST00000186746 1368 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mmp11Q02853 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms