Protein–RNA interactions for Protein: Q02788

Col6a2, Collagen alpha-2(VI) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,034 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col6a2Q02788 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 N6amt1-201ENSMUST00000054442 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Ginm1-201ENSMUST00000039763 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44484-201ENSMUST00000199873 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44466-201ENSMUST00000200264 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm44359-201ENSMUST00000200671 138 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Col6a2Q02788 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Fam178b-202ENSMUST00000170295 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nat8f3-202ENSMUST00000168531 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Slc22a16-202ENSMUST00000078314 2269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 3830406C13Rik-207ENSMUST00000223927 1010 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Cdkn1a-201ENSMUST00000023829 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Pcdhb22-201ENSMUST00000097609 2266 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Slc25a11-201ENSMUST00000014750 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Col6a2Q02788 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.4 ms