Protein–RNA interactions for Protein: Q02780

Nfia, Nuclear factor 1 A-type, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NfiaQ02780 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
NfiaQ02780 Cmc2-205ENSMUST00000148235 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ptpn2-201ENSMUST00000025420 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Vps25-203ENSMUST00000100414 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm20481-201ENSMUST00000173680 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Psmb4-201ENSMUST00000005923 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm38575-203ENSMUST00000215824 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gipc2-201ENSMUST00000046614 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rasd2-201ENSMUST00000132133 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Mir8117-201ENSMUST00000184773 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Crb3-201ENSMUST00000071826 1194 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm4913-201ENSMUST00000117075 1290 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm13431-203ENSMUST00000147012 388 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tmem9-205ENSMUST00000165125 901 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm44662-201ENSMUST00000206970 412 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Ly6k-201ENSMUST00000060301 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Syne4-201ENSMUST00000054594 1355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Pak1ip1-201ENSMUST00000046951 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Atp8b2-202ENSMUST00000107396 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Tfap2b-202ENSMUST00000064976 1946 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Cpt2-203ENSMUST00000106720 1015 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Taf3-202ENSMUST00000114906 583 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
NfiaQ02780 Rhox7b-201ENSMUST00000115156 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms