Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Ppp2r1a-201ENSMUST00000007708 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GscQ02591 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tbp-201ENSMUST00000014911 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Zfp202-203ENSMUST00000168832 3329 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 E330011M16Rik-201ENSMUST00000193614 1794 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Klf15-202ENSMUST00000113530 2374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gclc-201ENSMUST00000034905 3423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kcnn1-201ENSMUST00000110078 4047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kcnn1-202ENSMUST00000110081 4045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dcaf17-201ENSMUST00000064141 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Dnajc2-204ENSMUST00000115195 1994 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mllt1-201ENSMUST00000025053 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Maged2-201ENSMUST00000026302 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Zswim1-201ENSMUST00000017908 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
GscQ02591 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Slc25a39-201ENSMUST00000018821 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
GscQ02591 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.3 ms