Protein–RNA interactions for Protein: Q01887

Ryk, Tyrosine-protein kinase RYK, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RykQ01887 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rsbn1-202ENSMUST00000068879 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm13563-202ENSMUST00000150375 851 ntTSL 3 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Hand1-203ENSMUST00000160392 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
RykQ01887 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Chrna2-202ENSMUST00000206455 1933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Insl6-201ENSMUST00000052380 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Dusp14-205ENSMUST00000164891 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Snx18-201ENSMUST00000109241 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Pum2-202ENSMUST00000111122 6311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Bri3bp-201ENSMUST00000049040 6473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
RykQ01887 Adck1-204ENSMUST00000222695 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
RykQ01887 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.7 ms