Protein–RNA interactions for Protein: Q01822

Hoxd1, Homeobox protein Hox-D1, mousemouse

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd1Q01822 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.94□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rhoj-202ENSMUST00000118602 2396 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Adam23-204ENSMUST00000114103 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Uba52-203ENSMUST00000125184 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gramd3-201ENSMUST00000070166 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Tbrg4-212ENSMUST00000189268 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Nmt2-203ENSMUST00000102989 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
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Hoxd1Q01822 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Hoxd1Q01822 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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