Protein–RNA interactions for Protein: Q01768

Nme2, Nucleoside diphosphate kinase B, mousemouse

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme2Q01768 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zfp930-203ENSMUST00000212312 493 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mettl27-202ENSMUST00000068617 1685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm38575-201ENSMUST00000213881 652 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 AC164441.1-201ENSMUST00000221369 1004 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 D430001F17Rik-201ENSMUST00000141344 1858 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gnb3-201ENSMUST00000024206 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rgs9-202ENSMUST00000103062 1743 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Psmc4-201ENSMUST00000032824 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm11127-201ENSMUST00000113742 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Fam76a-202ENSMUST00000097856 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mdk-202ENSMUST00000069423 773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm12260-201ENSMUST00000122447 411 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm27646-201ENSMUST00000183989 110 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Gm43661-201ENSMUST00000199099 687 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 AC159106.1-201ENSMUST00000224421 690 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Zbtb46-202ENSMUST00000087409 2577 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Nme2Q01768 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.9 ms