Protein–RNA interactions for Protein: Q01514

Gbp1, Guanylate-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 589 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbp1Q01514 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Nabp2-204ENSMUST00000166608 979 ntTSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm10190-201ENSMUST00000086549 324 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Slc39a1-201ENSMUST00000015467 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm18856-201ENSMUST00000178096 1374 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm42456-201ENSMUST00000196840 387 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Shank1-201ENSMUST00000107934 6477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Spon1-202ENSMUST00000084696 5201 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Cux2-201ENSMUST00000086317 5113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Tsfm-207ENSMUST00000152054 655 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eda-205ENSMUST00000113778 4942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eda-207ENSMUST00000113780 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eda-208ENSMUST00000113781 4915 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Gbp1Q01514 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Fbxo17-205ENSMUST00000167118 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Gbp1Q01514 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms