Protein–RNA interactions for Protein: Q01320

Top2a, DNA topoisomerase 2-alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,528 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top2aQ01320 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pmf1-201ENSMUST00000056370 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Letmd1-201ENSMUST00000037001 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Mael-202ENSMUST00000194057 1691 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Sfxn5-203ENSMUST00000113787 638 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pcp2-203ENSMUST00000133459 470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 AA465934-202ENSMUST00000176545 356 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Psmg3-202ENSMUST00000182602 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pcp2-201ENSMUST00000004749 495 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 A930006K02Rik-201ENSMUST00000149172 776 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ftl1-ps1-202ENSMUST00000222435 938 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm44872-201ENSMUST00000207864 420 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Aldh1a3-203ENSMUST00000174209 1496 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Cnbp-203ENSMUST00000113619 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Top2aQ01320 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Oas1g-201ENSMUST00000086368 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 P2rx3-201ENSMUST00000028465 1812 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Rps19-201ENSMUST00000108428 1284 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Mt3-201ENSMUST00000034211 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 1700080E11Rik-201ENSMUST00000035180 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm8396-201ENSMUST00000057361 823 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ldha-210ENSMUST00000209984 1815 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Hoxb8-203ENSMUST00000168043 1141 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Cfdp1-201ENSMUST00000034432 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Atp2c1-205ENSMUST00000163879 2408 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Trem2-202ENSMUST00000113237 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm5069-201ENSMUST00000050581 1328 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Slc39a1-ps-201ENSMUST00000120862 969 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Top2aQ01320 AC155252.2-201ENSMUST00000226946 680 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms