Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tdrd6-201ENSMUST00000045717 7055 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm14317-201ENSMUST00000151754 1464 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cobl-201ENSMUST00000046755 5615 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gja4-201ENSMUST00000053753 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Slc35b2-202ENSMUST00000223987 1766 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Slc25a20-201ENSMUST00000035222 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Snx8-204ENSMUST00000196130 2547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rgp1-203ENSMUST00000117140 1635 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 4930515G01Rik-201ENSMUST00000173208 1247 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 5430416N02Rik-202ENSMUST00000181873 626 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 D030044L04Rik-201ENSMUST00000204220 1291 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gm26825-201ENSMUST00000181751 2026 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fbxo31-201ENSMUST00000059018 4358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mrm2-201ENSMUST00000031536 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fam46b-201ENSMUST00000051676 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zfp612-202ENSMUST00000212754 4863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Mff-211ENSMUST00000161648 1715 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC11.34□□□□□ -0.59
PrcdQ00LT2 Gatad2a-203ENSMUST00000177851 5007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms