Protein–RNA interactions for Protein: Q00977

Gjb2, Gap junction beta-2 protein, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gjb2Q00977 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Large2-201ENSMUST00000068586 2445 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ruvbl2-205ENSMUST00000211214 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mbp-206ENSMUST00000102812 2108 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mars-201ENSMUST00000037290 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tubb4b-201ENSMUST00000043584 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Keap1-201ENSMUST00000049567 3172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Trappc11-202ENSMUST00000120987 2060 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Fam57a-205ENSMUST00000169560 1806 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Gjb2Q00977 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms