Protein–RNA interactions for Protein: Q00896

Serpina1c, Alpha-1-antitrypsin 1-3, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Serpina1cQ00896 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Kctd6-202ENSMUST00000170111 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC17.64■□□□□ 0.42
Serpina1cQ00896 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Poli-203ENSMUST00000159389 2662 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Sumo1-201ENSMUST00000091374 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Gm11767-201ENSMUST00000129379 493 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 D830030K20Rik-204ENSMUST00000225885 1142 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Acp7-201ENSMUST00000040112 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Nhlrc4-201ENSMUST00000085027 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tfap2d-201ENSMUST00000037294 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Zfp42-202ENSMUST00000209356 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Hsf4-201ENSMUST00000036127 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Rhoc-202ENSMUST00000106787 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Trim7-202ENSMUST00000109213 2356 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 4933436I20Rik-201ENSMUST00000189405 1434 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Serpina1cQ00896 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms