Protein–RNA interactions for Protein: Q00731

Vegfa, Vascular endothelial growth factor A, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VegfaQ00731 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Lmnb2-202ENSMUST00000105332 1643 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm26718-201ENSMUST00000181048 1378 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ppif-201ENSMUST00000022419 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rabggta-201ENSMUST00000062861 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Vamp8-201ENSMUST00000059983 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Chst13-201ENSMUST00000070890 1653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rom1-201ENSMUST00000096242 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Pak4-202ENSMUST00000108283 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ydjc-201ENSMUST00000069064 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Alox12-202ENSMUST00000108574 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Igfbp1-201ENSMUST00000020704 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
VegfaQ00731 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gmppa-202ENSMUST00000113584 1692 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Ascl2-202ENSMUST00000121862 814 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm17178-201ENSMUST00000163273 357 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Jpx-202ENSMUST00000182447 712 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44357-201ENSMUST00000195897 142 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm19658-201ENSMUST00000196231 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44367-201ENSMUST00000196836 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44350-201ENSMUST00000197197 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44390-201ENSMUST00000197533 144 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44313-201ENSMUST00000198018 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44486-201ENSMUST00000198508 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44314-201ENSMUST00000199263 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
VegfaQ00731 Gm44394-201ENSMUST00000199558 138 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.7 ms