Protein–RNA interactions for Protein: Q00558

F8a1, Factor VIII intron 22 protein, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
F8a1Q00558 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Slc48a1-201ENSMUST00000117892 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cpne6-207ENSMUST00000171643 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gda-201ENSMUST00000087600 5428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Pgap2-203ENSMUST00000120119 1979 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Nkx1-2-201ENSMUST00000054562 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Slc29a4-201ENSMUST00000058418 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
F8a1Q00558 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Sf1-203ENSMUST00000113488 2282 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Gm14634-201ENSMUST00000139163 1662 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
F8a1Q00558 Rassf7-208ENSMUST00000209500 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms