Protein–RNA interactions for Protein: P99026

Psmb4, Proteasome subunit beta type-4, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb4P99026 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Erg-207ENSMUST00000171646 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tmem248-202ENSMUST00000111298 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Golt1a-201ENSMUST00000094557 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Elp6-201ENSMUST00000068071 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ankrd40-201ENSMUST00000021227 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Map3k6-201ENSMUST00000030677 4334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Usp35-202ENSMUST00000168435 3982 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Pxn-201ENSMUST00000067268 3706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 H2-K1-205ENSMUST00000172912 1570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tyro3-201ENSMUST00000028763 3989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Gabrd-201ENSMUST00000030925 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Wnt5b-202ENSMUST00000118120 2115 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Rnf14-203ENSMUST00000171461 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Tmem184b-201ENSMUST00000074991 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Psmb4P99026 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Men1-201ENSMUST00000056391 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 R74862-202ENSMUST00000133630 2482 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Rbfox2-206ENSMUST00000227314 1810 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Psmb4P99026 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.2 ms