Protein–RNA interactions for Protein: P98191

Cds1, Phosphatidate cytidylyltransferase 1, mousemouse

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cds1P98191 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ldha-201ENSMUST00000005051 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Npdc1-202ENSMUST00000071442 1485 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nup98-205ENSMUST00000211022 3132 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Asb2-204ENSMUST00000149431 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm44729-201ENSMUST00000206759 2052 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Arrdc1-202ENSMUST00000102935 1574 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Fmnl3-201ENSMUST00000081224 4137 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Htatsf1-201ENSMUST00000088652 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ube2r2-201ENSMUST00000040008 3600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Zbtb16-202ENSMUST00000216150 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm6588-201ENSMUST00000100882 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Mettl21a-202ENSMUST00000114079 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Chga-201ENSMUST00000021610 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pgc-201ENSMUST00000024782 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Inhbc-201ENSMUST00000026472 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Matn1-201ENSMUST00000102576 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Esr1-203ENSMUST00000105589 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Dok1-201ENSMUST00000089651 1807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Zbtb48-201ENSMUST00000066715 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Cds1P98191 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms