Protein–RNA interactions for Protein: P97489

Gata5, Transcription factor GATA-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata5P97489 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Hexb-201ENSMUST00000022169 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Slc35f4-205ENSMUST00000146164 2480 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zfp862-ps-203ENSMUST00000203848 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Cidec-202ENSMUST00000113089 1720 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Gata5P97489 Lrrc42-201ENSMUST00000030360 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Prr23a3-201ENSMUST00000167951 1817 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 T-201ENSMUST00000074667 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Fam184a-201ENSMUST00000020003 4164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Slc3a2-202ENSMUST00000170157 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 B230217O12Rik-201ENSMUST00000181921 1642 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Steap2-202ENSMUST00000115424 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Smtn-201ENSMUST00000020718 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Abraxas1-202ENSMUST00000055245 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm29340-201ENSMUST00000188763 3854 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Syngr3-201ENSMUST00000007236 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Map3k3-201ENSMUST00000002044 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Rbfox3-203ENSMUST00000103023 2809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gpr3-202ENSMUST00000105911 2518 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gypc-203ENSMUST00000174459 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Gm36967-201ENSMUST00000193814 266 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Sil1-201ENSMUST00000025215 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Gata5P97489 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.5 ms