Protein–RNA interactions for Protein: P97474

Pitx2, Pituitary homeobox 2, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx2P97474 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 9530059O14Rik-202ENSMUST00000181682 2093 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.39□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zfp281-202ENSMUST00000112046 4937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Jakmip1-202ENSMUST00000121010 2496 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tmem56-203ENSMUST00000128909 6696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.38□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mbd6-201ENSMUST00000026476 4165 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tango6-202ENSMUST00000211979 2722 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Nap1l4-209ENSMUST00000209098 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 C2cd2l-206ENSMUST00000214602 2808 ntTSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mars-206ENSMUST00000171564 2962 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Slc4a1ap-206ENSMUST00000201858 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tex264-201ENSMUST00000046735 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Sik2-201ENSMUST00000041375 3552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Klhl29-201ENSMUST00000020958 7041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Fam155a-206ENSMUST00000208933 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ccr9-202ENSMUST00000163559 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Hist1h3g-201ENSMUST00000080859 530 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Akirin1-201ENSMUST00000102636 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Slc45a4-204ENSMUST00000132607 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Chrna4-201ENSMUST00000067120 4565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Mief1-202ENSMUST00000166030 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Kif12-205ENSMUST00000156618 2258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
Pitx2P97474 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.6 ms