Protein–RNA interactions for Protein: P97443

Smyd1, Histone-lysine N-methyltransferase Smyd1, mousemouse

Predictions only

Length 490 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smyd1P97443 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Prr5l-201ENSMUST00000043845 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Lias-202ENSMUST00000122026 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pofut1-204ENSMUST00000109794 1688 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Psen2-203ENSMUST00000111105 1575 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pnpla2-202ENSMUST00000064151 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Fnbp1-204ENSMUST00000100208 1859 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Agfg1-204ENSMUST00000186302 2352 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Olah-202ENSMUST00000115087 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dpys-201ENSMUST00000022915 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dmc1-201ENSMUST00000023065 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ehmt2-202ENSMUST00000078061 3746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dmpk-203ENSMUST00000108474 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pias4-201ENSMUST00000005064 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm29455-202ENSMUST00000186697 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Zfp385b-202ENSMUST00000111829 2073 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Pde4b-208ENSMUST00000106911 3020 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Dag1-203ENSMUST00000171412 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 1110065P20Rik-204ENSMUST00000163946 762 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Smyd1P97443 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms