Protein–RNA interactions for Protein: P97390

Vps45, Vacuolar protein sorting-associated protein 45, mousemouse

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps45P97390 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Ankrd10-201ENSMUST00000033905 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Gm40773-201ENSMUST00000218113 1502 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Gm5712-201ENSMUST00000199748 1043 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Dcps-201ENSMUST00000034539 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Disc1-206ENSMUST00000118942 2860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Dok3-202ENSMUST00000223563 1644 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Sirt6-202ENSMUST00000119324 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Il7-203ENSMUST00000192202 2057 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Casq1-201ENSMUST00000003554 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Naprt-201ENSMUST00000023237 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Snx2-201ENSMUST00000037850 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Vps45P97390 Cd164-201ENSMUST00000019962 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Cox6c-205ENSMUST00000156915 606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ndufaf8-202ENSMUST00000185558 427 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm44430-201ENSMUST00000203376 995 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Sctr-202ENSMUST00000189037 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Bpifb3-201ENSMUST00000088950 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 B4galt7-201ENSMUST00000064701 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 1600014C10Rik-209ENSMUST00000179992 568 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Rgma-204ENSMUST00000139780 3371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Serpine2-201ENSMUST00000027467 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps45P97390 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms